Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acod1P54987 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms