Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XpcP51612 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XpcP51612 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XpcP51612 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XpcP51612 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
XpcP51612 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XpcP51612 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XpcP51612 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XpcP51612 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms