Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorcP51450 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorcP51450 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorcP51450 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms