Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa6P50704 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa6P50704 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa6P50704 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Defa6P50704 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms