Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrp3P50462 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms