Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl11P48298 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl11P48298 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms