Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd4P46935 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms