Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf1P46099 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf1P46099 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klf1P46099 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms