Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist1h1bP43276 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist1h1bP43276 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms