Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtgfrP43117 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms