Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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