Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd1P40201 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd1P40201 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd1P40201 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd1P40201 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd1P40201 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chd1P40201 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chd1P40201 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms