Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp3P39876 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp3P39876 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp3P39876 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp3P39876 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp3P39876 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timp3P39876 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp3P39876 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms