Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd28P31041 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd28P31041 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd28P31041 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms