Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk4P30285 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk4P30285 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms