Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprmP28828 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprmP28828 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprmP28828 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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