Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PparaP23204 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PparaP23204 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PparaP23204 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PparaP23204 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PparaP23204 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PparaP23204 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms