Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms