Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clk1P22518 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clk1P22518 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clk1P22518 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms