Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms