Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms