Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs1P17533 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms