Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsaP16675 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsaP16675 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsaP16675 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms