Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms