Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OtcP11725 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtcP11725 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtcP11725 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtcP11725 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtcP11725 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtcP11725 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtcP11725 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms