Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms