Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms