Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01679 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01679 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01679 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01679 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01679 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01679 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01679 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01679 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01679 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01679 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01679 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01679 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01679 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms