Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01643 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01643 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01643 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01643 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01643 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01643 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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