Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tom1O88746 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms