Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn2O88703 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hcn2O88703 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms