Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap1O55125 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms