Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms