Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FxnO35943 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FxnO35943 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FxnO35943 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FxnO35943 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FxnO35943 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FxnO35943 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms