Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc27a2O35488 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc27a2O35488 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms