Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prrt1O35449 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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