Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih1O35372 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms