Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhe40O35185 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe40O35185 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe40O35185 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms