Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad6O35182 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad6O35182 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms