Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarb2O35114 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarb2O35114 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms