Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sypl1O09117 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms