Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3424L7N298 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3424L7N298 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms