Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20878L7N244 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms