Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1oL7MU04 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1oL7MU04 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms