Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms