Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms