Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms