Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cald1E9QA15 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cald1E9QA15 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms