Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdh18E9Q9Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms