Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r152E9Q9N3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r152E9Q9N3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms